Skocz do zawartości
Forum Kopalni Wiedzy
KopalniaWiedzy.pl

Tania analiza DNA

Rekomendowane odpowiedzi

BGI, największy na świecie instytut genomiki, uruchomił skierowaną do naukowców na całym świecie tanią usługę wykonania analizy bioinformatycznej dotyczącej głębokiego sekwencjonowania (NGS - Next-Generation Sequencing) DNA.

W ramach usługi „EasyGenomics“ Chińczycy oferują chmurę obliczeniową wraz z pełnym zestawem narzędzi niezbędnych do przesłania sekwencji DNA i wykonania jej analizy.

System BGI wykorzystuje procesory graficzne Tesla M2070 i M2075 Nvidii. Dzięki nim oraz zastosowaniu architektury chmur obliczeniowych możliwe stało się skrócenie czasu potrzebnego do przeprowadzenia analizy z kilku dni do kilku godzin. To w znakomitym stopniu przyspiesza prace naukowców oraz obniża koszty badań.

„Akceleracja oprogramowania przez procesory graficzne umożliwia analizowanie łańcuchów DNA szybciej niż kiedykolwiek. Skróciliśmy czas analizy z pięciu dni do pięciu godzin.  Usługa EasyGenomics po pełnym wdrożeniu w chmurze może zrewolucjonizować badania genetyczne“ - powiedział doktor Lin Fang, wiceprezes BGI.

System jest ciągle rozbudowywany, gdyż spadające koszty analizy powodują, iż coraz więcej osób i instytucji może pozwolić sobie korzystanie z tego typu usług.

„Koszty sekwencjonowania gwałtownie spadają – są szanse, że w tym roku osiągniemy próg cenowy 1000 USD za przeprowadzenie jednej analizy.  Oczekujemy ogromnego napływu danych od podmiotów zajmujących się sekwencjonowaniem DNA“ - stwierdził Sumit Gupta, dyrektor ds. produktów Tesla w Nvidii.

Procesory graficzne Tesla to przeznaczone do obliczeń równoległych akceleratory oparte na platformie CUDA firmy Nvidia. Tesla zostały zaprojektowane z myślą o obliczeniach wielkoskalowych oraz badań obliczeniowych i superkomputerach, zapewniając znacząco wyższy poziom akceleracji w wielu aplikacjach naukowych i komercyjnych od rozwiązań opartych na samych procesorach centralnych. Procesory te napędzają trzy z pięciu najpotężniejszych superkomputerów na świecie.

Udostępnij tę odpowiedź


Odnośnik do odpowiedzi
Udostępnij na innych stronach

Jeśli chcesz dodać odpowiedź, zaloguj się lub zarejestruj nowe konto

Jedynie zarejestrowani użytkownicy mogą komentować zawartość tej strony.

Zarejestruj nowe konto

Załóż nowe konto. To bardzo proste!

Zarejestruj się

Zaloguj się

Posiadasz już konto? Zaloguj się poniżej.

Zaloguj się

  • Ostatnio przeglądający   0 użytkowników

    Brak zarejestrowanych użytkowników przeglądających tę stronę.

×
×
  • Dodaj nową pozycję...